澎湖南方四島國家公園海域擁有豐富的漁業資源，這裡的海洋生態系統多樣性高，吸引了大量的季節性洄游魚群。然而，為了保護這一寶貴的自然資源，海洋國家公園管理處在去年底展開了例行巡查，並在東吉海域查獲了違規採捕的漁船，這些船隻涉嫌違反相關的漁業法規。
根據內政部國家公園署的報告，該次巡查於2022年12月29日進行。巡查人員在東吉東側海域發現了一艘拖網漁船，這艘漁船正在從事非法的拖網捕撈。在確認違規情況後，管理處迅速採集相關證據，並將取證資料移交給漁業主管機關，後續將由其進行處罰和裁處。
隨著冬季的來臨，大批的土魠鰆和白腹鰆等洄游魚群也隨著洋流南下，進入澎湖南海水域。為了保護合法漁業和海洋資源，東吉管理站根據當前的海況和天氣預報，靈活調整巡查計畫，並增加保護巡查的次數。例如，在1月5日進行的一次巡查中，紀錄到8艘傳統漁船正在從事季節性魚種的捕撈作業。
澎湖南方四島國家公園致力於在保持海洋生態系統平衡的同時，支持當地居民的傳統漁業活動。管理處表示，該公園內只允許存有合法許可的傳統季節洄游性漁業活動，這一政策旨在確保合法漁民的生計與海洋生態實現共存，使生態保育與漁業經濟達到雙贏的效果。
管理處特別提醒民眾，在國家公園內，所有形式的電魚、毒魚、炸魚以及潛水打魚行為都是被禁止的，此外，也對近岸3浬內從事拖網捕撈活動的漁業行為及娛樂漁業漁船、遊艇、自用小船及載客小船等進行嚴格的管制，確保這片海域的生態環境不受破壞。
截至2023年度，澎湖南方四島海域已經執行了243次巡查，並進行了27次空拍機監控，查獲145名違法捕撈行為人，並對58人進行勸導，累計裁罰55人次。這些數據彰顯了管理處在維護漁業資源和保護海洋生態系統方面的堅定決心與努力。
